玉溪市委开展减税降费及优化营商环境专项巡察发现，市政务服务管理局、市发展改革委、市生态环境局、市住建局、市民政局等单位在减税降费及优化营商环境工作中，存在站位不高，履职不到位，形式主义、官僚主义及违反中央八项规定精神等问题。这些问题，充分反映出这些单位全面从严治党“两个责任”压得不实，部分党员领导干部“四个意识”树得不牢、敷衍塞责、推诿扯皮、不知敬畏、心存侥幸、顶风违纪等问题依然存在。
玉溪市委坚定扛起全面从严治党主体责任。针对存在问题，市政务服务管理局党组、市发展改革委党组、市生态环境局党组、市住建局党组、市民政局党组决心知耻后勇，以肃清秦光荣流毒为契机，深刻剖析，举一反三，公开曝光自身存在的问题，并向社会承诺，迅速行动、研究措施，坚决抓好整改，接受社会和群众监督。
一、工作落实不力、牵头责任不到位问题。2018年7月至2019年10月，玉溪市政务服务管理局1年多均未召开专题会议研究优化营商环境工作。制定进一步优化营商环境的若干意见工作任务分解表照抄照搬，将“跨境经济合作区”“边境经济合作区”“加快口岸通关便利化”等与全市情况不相符的内容进行任务分解。市发展改革委作为降低实体经济企业成本联席会议召集单位，“联席会议半年召开一次，一年不少于两次”的要求未抓实。2019年1月至10月，“一部手机办事通”APP上线试运行以来，系统注册用户达10万余人，但业务办理量只有0.9万件。2018年6月至2019年11月，市医疗保险参保网上经办系统投入使用，全市参保单位7627家，使用系统进行业务办理的有93家，使用率1.2％。
二、对中介机构的监管缺失问题。玉溪市政务服务管理局、市市场监督管理局、市国资委等相关部门在整治中介机构乱收费行为工作中相互推诿，没有发挥牵头或责任部门作用，审批过程中介环节多、收费多。玉溪研和工业园区装备制造产业标准厂房建设项目从立项到工程完工，中介服务收费24项，行政事业性收费和政府性基金各1项，共收费365万元，占工程投资额的6％。中石油连接线道路工程，中介服务收费19项，行政事业性收费和政府性基金各1项，共收费197万元，占工程投资额的5.3％。云南省玉溪市兴化纸业有限公司在办理不动产权籍数据入库时，测绘中介公司出具的材料问题较多，告知不明确，企业反复修改5次才完成办理。
三、动物卫生监督机构违规转嫁费用问题。玉溪市红塔区农业农村局要求云南玉溪凤凰生态食品有限责任公司自筹资金建设非洲猪瘟检测实验室，购买两台猪瘟检测设备和检测试剂对非洲猪瘟烈性传染疫病进行检测，该公司以每25头100元的标准向养殖户收取抽检费。
四、原玉溪市环保局违规使用下属协会经费问题。2009年9月，玉溪市环境产业保护协会投资成立玉溪市毓德环境工程评估有限公司，开展环境咨询评估业务，至2017年营业收入累计达到898.14万元，其中315.13万元上交玉溪市环境产业保护协会。2012年6月至2013年1月，原市环保局使用玉溪市环境保护产业协会经费购买运动服装、生日购物卡等发放给干部职工，共计2.87万元。
五、玉溪市房管局违规使用下属协会经费报销差旅费问题。2015年至2019年，市房管局多名领导干部参加省内外房地产协会组织的学习、交流、考察等活动，在玉溪市房地产协会报销差旅费，共计34.13万。
六、玉溪市民政局及业务主管（指导）单位对行业协会监管不到位的问题。玉溪市房地产业协会、玉溪市旅游行业协会、玉溪市个体私营经济协会未按期进行换届，行业协会自身管理混乱，存在行业协会与行政机关未完全脱钩、明脱暗不脱、强制入会、强制收费、行业协会经营性获利、行业协会会费（经费）成为行业主管部门“小金库”等问题。