道光二十七年（公元1847年）正月初二日，林则徐补授云贵总督，六月抵昆明上任。七月二日，道光皇帝降旨林则徐为钦差大臣，到永昌查办屠杀回民的案子。道光二十八年（1848）二月二十七日林则徐抵永昌，到三月初一离开，共三天时间对“永昌案”进行查办。本着“只分良莠，不分回汉”的原则，查办了汉回为首闹事的哨练头目，平息了永昌动乱。
剿抚兼施
道光二十八年（1848）云贵总督林则徐，统兵从昆明西上永昌，处理汉回互斗案。消息传出后，永昌汉回民众议论纷纷。而那参与屠杀回民和有关联的汉族上层人士则异常恐慌。他们大造舆论，企图稳住人心，并编一顺口溜传播说：“双木不成材，枉自永昌来；汉回些子事，看你怎安排！”
后来，还留下一个力图打乱林则徐处理事变方略的传说：“林则徐奉旨领兵西上，一路剿办汉民，不分良莠，玉石俱焚。”永昌有人献策说：“林则徐素重调查，曾亲自榜书一副堂联‘求通民情，愿闻己过’。我们赶快将举人、秀才、童生等识字的集中起来，让他们背上四书五经，到霁虹桥、水寨、牛角关一带林则徐必经要道，分散沿路农家，日夜诵读，好让林则徐知道永昌确实是文献名邦，礼乐之乡，他必定手下留情”。据说，这办法果然奏效。林则徐将大军暂驻永平，自己带几个随从微服私访，一过霁虹桥，沿途传来琅琅书声，一派文雅弦歌风气，大受感动，遂奏请道光帝将剿办改为剿抚兼施。
传说虽如此，与事实却有出入。根据光绪《永昌府志》记载：林则徐亲临永昌驻扎三日，汉族绅耆慑服，将汉民罪魅祸首430余名缚献。经严讯后，处决145名、军流180余名、徒杖者100余名；回民中也有被凌迟、斩枭斩决者。受惩处者汉回都有，是按照“不问汉回，只问良莠”的方针处置的，所以受到汉回民众的拥护。
后来，举人盛毓华撰文评说：“迤西一带数年悍俗刁风，一朝洗荡，虽武乡侯之平南蛮，裴晋公之克淮蔡，曹武惠之下江南，未有成功如是之速，用德如是之平者；我制军之功既高，而德亦大矣！”
“摇和尚”与“淋大人”
当林则徐驻兵永平时得知：永昌城内情况非常复杂，为首闹事的沈聚成等仍在蓄谋作乱，汉回民众人心惶惶，于是火速提兵出发。
过了霁虹桥，进驻官坡一座寺院。寺院住持俗姓姚，人称姚和尚，知书识礼，谈吐不俗，给了林则徐一个好的印象。
是夜，一天鞍马疲劳，本想早点休息的林则徐，见寺后山林间忽然刮起一阵大风，他警惕地步出厅堂，来到院内查看动静，只见大风起处，尘土飞扬，瞬间将大殿里的十八罗汉，遮得面目昏暗，好象摇摇晃晃。他被眼前的景象触发灵感，得一上联，精神为之一振，脸上洋溢出轻快的笑意，立刻将姚住持请到厅堂说：“刚才我听见殿角铁马叮当，出去查看，发现大殿里那些罗汉被大风吹得东倒西歪，偶得一支上联，你能对否？”林则徐忍住笑声，拈须念道：“风吹罗汉摇和尚”。姚住持一听，知道这上联是冲着自己而来，竟将我姚和尚嵌进去。此时此刻，风声、铁马声，夹着滴滴嗒嗒的一阵雨声从空而降。雨点唰唰打在默立走廊上的四大金刚身上。姚住持立即朗声对道：“雨打金刚淋大人”。
林则徐大为惊异。人传永昌为文献名邦，文人学士善对本不足奇，而身离红尘的僧道也才思敏捷，实在难能可贵。我是以“摇”与“姚”的谐意出对。虽然新颖，但是文辞尚觉有牵强之嫌，而姚住持则将“淋”与“林”的谐音相对，且词语自然流畅，天衣无缝，十分贴切工稳。永昌这文献名邦，果然名不虚传，连出家人也满腹经纶，应对如流，可敬可敬！
计擒金混秋
林则徐惩办的罪魁祸首，其中凌迟者有一名以巫术煽惑为乱的金混秋，浑名铁幅子。他原在少数民族中从事剽窃勾当，被傣族群众所痛恨，无法立足蹿来保山，为七哨练兵总头目沈聚成等传授所谓紧皮药，他说吃了此药皮肉紧缩刀枪不入，而且对性情懦弱的人，立刻强悍暴燥，勇敢战斗，还说他能调动阴兵，一旦招来，可敌千军万马。沈聚成借此向永昌知府李恒谦扬言称誉说，金混秋有神术，能知未来祸福。这位知府大人竟深信不疑。于是让金混秋大摇大摆进入保山城内鹤云寺，一月领取60两银子的厚禄，并开始出售紧皮药，传授咒语。民众听说他是沈聚成的师父，愈加敬重，求药者日以千百计，不少人愿意服役门下为弟子，而得一符一咒一药。
保山县知事韩捧日，对金混秋的所作所为非常愤恨，向永昌知府说其利害，建议将他驱逐出境，以免滋生祸端。知府只好赠给金混秋银子百两，令府差秘密遣送出境。可是金混秋刚到上江，又被沈聚成养子沈振达等人接回了保山，藏在城北卧佛寺，继续卖药传授邪术。
后来，林则徐从昆明统兵西上，驻扎永平，令迤西道王发越将祸首周文庠，石维沂等9名案犯提解昆明。沈振达等在金混秋巫术蛊惑下发动暴乱，当知府李恒谦，知县韩捧日和协镇等亲率练兵400名，将9名案犯押解到官坡时，突然牛角号声响起，炮声隆隆，乌合之众遍山满谷拥来，大呼：“还我起解人！”“杀尽解犯官！”练兵正在抵抗，又蹿出一群披发裸体的金混秋徒弟，狂呼而来。练兵不敢抵抗，纷纷将枪械丢掷路旁，俯首乞命。9名案犯遂被劫走，并掠去金银、马匹、衣物、枪械。府县各官所乘大轿被砸得粉碎。继而沈振达又率众一拥入城劫狱，杀害回民，纵火焚烧县署。
林则徐面对如此复杂严峻局势，遂亲临永昌城。金混秋见林则徐亲临保山，自知骗术即将败露，于是隐藏到城东南萧祠内不敢露面。经林则徐派人侦察获悉又派兵暗暗包围萧祠，再令人假托向金混秋“打卦”预卜凶吉，诱其出门。金混秋将信将疑，带领随从8人出门。埋伏的官兵趁其不备，一拥而上将他擒获，处以绞刑。
功襄履坦
上巷街张文炳家的主楼檐前，曾悬挂着一块匾额，上书“功襄履坦”，是林则徐为张文炳题书的。光绪《永昌府志》记载：“张文炳，号著堂，邑庠彦。秉性孝友，持己方正，曾修补江边水石坎一带道路。制军林则徐赐一匾额曰：‘功襄履坦’。道光年间，汉回互斗，彼此猜忌，往往得其一言即解。其见重于乡里如是。”
读过这段记载，使人感慨不已。虎门销烟的民族英雄林则徐当年为封疆大臣，他来永昌的主要任务是解决汉回之间的矛盾，可是他在百忙的三天中，肯为永昌一介秀才因修道路、热忱地方公益，题书匾额进行表彰，不泯其功绩，足见林公处处关心民瘼的拳拳之心。
林则徐在永昌处理汉回冲突，采取“剿抚兼施”和“不问汉回，只问良莠”的正确方针，使长达七年多的祸乱得以平息，永昌举人盛毓华在《永昌汉回互斗》序言中高度评价说：林则徐“亲临督办，天威远震，不战屈人，元恶授首，小丑悉平，举数年之重冤积弊，一旦澄清，不啻挽东海之波澜，以涤尘垢，拨九天之云雾而重睹日光也。”后来保山官绅民众，为感激林则徐造福民众的功德，于菊花街建立林公祠堂，以示纪念。（杨永明）