根据统一部署，2016年5月中旬至7月中旬，云南省委10个巡视组对省委宣传部、省委机关事务管理局、云南中医学院等29个省直单位开展了巡视工作，共发现各类问题371个，发现问题线索61件（其中涉及省管干部34件）。8月15日至9月1日，省委各巡视组陆续向29家被巡视单位反馈巡视情况，并提出整改要求。
巡视发现，29个单位普遍存在党的领导弱化、全面从严治党“两个责任”落实不到位，重业务、轻党建、重大事项决策机制执行不好，财务管理不规范、部分领域存在较大廉洁风险和“四风”问题屡禁不绝、干部作风存在不严不实情况等共性问题。
党的领导弱化、全面从严治党责任落实不到位主要表现在：党的领导核心作用发挥不够，对归口管理联系单位的领导、管理和监督不到位。两个责任”落实不到位，重业务、轻党建现象突出，基层党组织建设薄弱，党建意识不强、组织生活不规范。全面从严治党要求落实不到位，抓大事议大事能力不足，对重点人、重点事、重点问题的监督存在盲区。
部分单位执行中央八项规定精神和省委实施办法力度不够，“四风”问题依然存在。办公用房超标准、公务接待不规范等现象时有发生。违规发放津补贴或奖金、虚报套取资金、超预算支出“三公经费”等问题依然存在，有的甚至违规占用外单位车辆，部分领域存在较大廉洁风险。部分单位课题经费管理不规范，存在课题经费使用“福利化”的现象。
一些单位在干部选拔任用方面不够规范，干部轮岗交流没有形成制度。部分单位对干部的管理失之于宽、失之于软，监督流于形式，管理松散、纪律松弛、作风不严不实问题依然存在。少数领导干部工作缺乏统筹性，作风不实，担当精神不足问题突出，个别领导干部“官本位”思想严重，存在机关化、行政化倾向。
巡视组在巡视反馈中要求，被巡视单位要认真对照省委巡视组提出的要求及相关具体问题，明确整改措施、责任领导、责任单位和进度，认真抓好落实。对不按要求整改或整改落实不力的，将严肃追究相关人员的责任，省委巡视工作领导小组将适时对整改落实情况开展监督检查。被巡视单位纷纷表示，将结合“两学一做”学习教育，认真对照省委巡视组指出的问题，逐条逐项抓好巡视整改工作，确保各项整改任务件件有着落、事事有回音。