石林县纪委监察局注重加强与法院、检察院、公安机关在处理案件过程中的协调配合作用，出台了《石林彝族自治县纪检监察机关与司法机关查办案件协作配合办法（试行）》，建立“信息互通、力量互助、优势互补、资源共享”办案新机制，全面提升突破大案要案能力，加大查办案件力度，确保涉案党员、干部受到党纪政纪处分及法律的制裁。
办法规定,纪委监察机关和司法机关要建立完善“五项制度”。一是建立联席会议制度，原则上每季度召开一次，由县纪委监察局、县人民法院、县人民检察院、县公安局领导轮流主持召开；二是建立情况信息交流和通报制度，县纪委监察局和县人民法院、县人民检察院、县公安局每个单位明确一名案件管理信息员，原则上每月进行一次信息交流和情况通报，遇有重要情况及时通报；三是建立工作会商制度，县纪委监察局和县人民法院、县人民检察院、县公安局应及时转送涉及相关部门的举报材料，积极会商，对案件线索进行分析评估。四是完善案件移送制度，县纪委监察局和县人民法院、县人民检察院、县公安局在查办案件过程中，发现党员干部有违纪违法问题的，应相互及时通报情况，在一个月内移送案件。五是建立联合办案制度。对案情复杂、涉及面广、涉案问题较多的党员干部违纪违法案件，县纪委监察局与县人民检察院、县公安局等机关应进行联合办案，按照各自职责，依照法定程序，组成专门办案组，集中人员、集中时间，整合资源，联合办理，确保案件查办工作顺利进行。
办法要求，要规范“三个环节”程序。一是完善移交手续。线索、案件移送工作要做到材料齐全、手续完备，严格按照涉密文件资料管理规定，专人递送、专人管理，移送和反馈要登记备查。二是迅速进行审查。县纪委监察局与县人民检察院、县公安局接到移送案件后，要及时进行审查，对应受理或立案查办的，及时办理受理或立案手续；经过审查，不予受理或立案的，书面告知移送单位不受理或不立案的理由，并将案件材料退回移送单位。三是及时反馈结果。案件办结后，接收单位应将案件各阶段进展情况向移送单位反馈，送达相关材料
办法指出，查办案件协作配合工作实行责任追究。县纪委监察局和县人民法院、县人民检察院、县公安局应当严格依照法定的职责、权限和程序协作配合查办案件工作。对在查办案件协作配合工作中，不按要求及时移送案件材料，推诿扯皮，瞒案不报，压案不查，失职渎职、贻误办案时机的单位或个人，依照有关规定，视情节轻重，追究有关责任人员的纪律责任，造成重大损失或严重影响的，依法追究其法律责任。